Le Centre Hospitalier de Luxembourg est un établissement public géré selon le droit privé sous la tutelle du Ministre de la Santé. Il est administré par une Commission Administrative composée de 13 membres représentant le Ministère de la Santé, la Ville de Luxembourg et la FNM (Fondation Norbert Metz) et le personnel.
La Direction du CHL est confiée à un Directeur Général assisté d’un Directeur Médical, des Soins et Administratif et Financier. Les activités cliniques sont regroupées dans 13 Départements Cliniques composés d’un ou de plusieurs services cliniques supportés par les activités cliniques de support. Les départements cliniques sont dirigés par un médecin chef de département et un cadre soignant chef de département. Ils dirigent conjointement le département sur base d’un partenariat médical et soignant. La Direction Administrative et Financière est composée de trois départements (Administration, Finances et Ressources Humaines) dirigés par des directeurs adjoints.